Q:PubMed IDのリストから文献情報を作成する方法

Answer

PubMed に収録されている論文にはPubMed ID (以下PMID) と呼ばれるIDが付与されており、PMIDのリストをEndNoteに取り込むことで、まとめて文献情報をライブラリに作成することができます。作成手順は以下の通りです。

1. PMID の確認

PMID はPubMed 検索結果一覧または各文献の詳細画面に表示されています。

検索結果一覧

詳細画面

2. 所定の形式でデータを作成

Excel などのスプレッドシートでPMID のリストを作成します。
Excel をご利用の方はこちらのテンプレート をご利用ください。
※ A 列の [Accession Number] の下にPMID を入力します。

PMID の入力が完了したら、[名前を付けて保存] で [ファイルの種類] から [テキスト(タブ区切り)] を選択し、保存します。

3. EndNoteでデータをインポート

EndNote のライブラリを起動し、メニューバーの [File] -> [Import] -> [File] を選択
※ Macintosh 版の場合は [File] -> [Import] を選択

[Import File] にて手順2で保存したテキストファイルを指定し、[Import Option] にて [Tab Delimited] を選択します。

Macintosh 版の場合は画面左下の [Options] をクリックしてから、[Import Options] を選択します。

[Import] ボタンをクリックすると、[Accession Number] 項目にPMID が入力された文献レコードがライブラリにインポートされます。

4. 文献情報を更新する

インポートしたレコードを選択し、メニューバーの [References] -> [Find Reference Updates] をクリックします。

更新情報が見つかると、見つかった情報が現在の情報と比較表示され、[Update All Fields] を選択すると、すべての情報が更新されます。

複数文献に対し [Find Reference Updates] を実行した場合は同じ処理を他のレコードに対しても実行するかどうか確認の画面が表示されますので、[はい] を選択します。

処理が完了すると、以下のように文献情報が自動入力された状態で表示されます。

PubMed 検索時にEndNote に入れたい論文のPMIDをメモしておき、後からまとめてEndNote に文献情報を取り込みたい時に便利な方法なので、是非ご活用ください。

【補足】

手順2のリストの項目を [Accession Number] から [DOI] に変更し、DOI の値を入力することで、同様の手順で文献情報を作成することができます。

※ 文献情報を取得できるのは PubMed, Web of Science, Crossref に登録されているDOI に限ります。日本語文献のDOI には対応しておりませんので、ご注意ください。

以上

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