EndNote から Word などに文献リストを出力した際、著者名や団体名（機関名）などが正しく表記されない場合は、EndNote ライブラリ内の文献情報の Author の情報がEndNote のルールに則った入力方法になっていない可能性があります。
下記をご参照の上、該当レコードの Author 欄をルールに則った入力方法になるよう編集してください。

Author 欄の入力ルール

EndNote の Author 欄では、最初のカンマまでを "姓"、その後ろを "名"、と判断するように設定されています。
そして、多くのアウトプットスタイルでは「名」をイニシャルにするよう設定されています（例外もあります）。
そのため、ルールに則っていない情報は変なところで省略（イニシャル化）されてしまいます。
なお、2つ目のカンマ以降の情報はそのまま出力する、というルールにもなっています。
※以上のことから、複数の著者名をカンマで区切って一行に入力してしまうと、正しく出力されません。複数の著者名を入力する場合は改行で区切る必要があります。
※カンマを一切含めないで名前を入力すると、また異なる形で姓・名を判断します。
下記＜入力例：個人名＞をご参照ください。

ルール

• 1行に 1名の名前のみ入力（＝1名ごとに改行して入力）
• 団体名（名称にカンマを含まない場合）は名称の最後に半角のカンマを入力※団体名の名称にカンマを含む場合は、最初の半角のカンマを二重に入力し、最後にカンマを入力しない。（下記＜入力例：団体名＞参照）

入力例：個人名

First Middle Last ( John F Kennedy )
Last, First Middle ( Kennedy, John F )
Last, First, Title ( Smith, Alfred, Jr )

入力例：団体名

U.S. Department of Agriculture,
Apple Computer Inc.,
University of California,, Irvine

※注目していただきたいカンマを赤字にしています。実際に入力するときは赤字になりません。
　（ライブラリに初めて登録する名前は全体が赤字で表記されますが、特に気にしなくて結構です）

入力例：日本語名

山田, 太郎　　※本文中の引用表記には姓のみを出力したいときなど、姓と名の区別を付けたいとき。
　　　　　　  　ただし、英語用のスタイル適用時に文献リストには " 山田, 太 " と出力されることが多いです。
　　　　　　  　日本語用のスタイルを適用しても " 山田 太郎 " と半角スペースが姓と名の間に入ります。 

山田太郎,　　 ※文献リストに " 山田太郎 " と出力したいとき。
　　　　　　  　ただし、本文中の引用表記を姓のみの出力にすることはできません。

以上をご確認いただき、ライブラリ内のレコードの Author 欄を編集していただいたらWord にて EndNote の出力をアップデートして変更をご確認ください。

以上